在近日于墨西哥巴亞爾塔港舉行的2024年分子生物學(xué)和進(jìn)化學(xué)會（SMBE）年會的一場會議上，德國馬克斯-普朗克進(jìn)化人類學(xué)研究所群體遺傳學(xué)家Stéphane Peyrégne，報(bào)告了從20萬年前男性身上發(fā)現(xiàn)的新的丹尼索瓦人基因組。該基因組是迄今最古老的高質(zhì)量人類基因組，比之前的紀(jì)錄保持者——生活在大約12萬年前的尼安德特人還要早8萬年。

這是14年前發(fā)現(xiàn)神秘古人類——丹尼索瓦人以來，研究人員通過骨骼化石發(fā)現(xiàn)的第二個(gè)基因組。第一個(gè)丹尼索瓦人基因組來自一個(gè)8萬年前到6萬年前女孩——丹尼索瓦3的小指骨。

丹尼索瓦人和尼安德特人的基因組來自同一個(gè)寒冷且化石豐富的地區(qū)——位于西伯利亞阿爾泰山脈的丹尼索瓦洞穴。

研究人員主要是通過DNA來了解丹尼索瓦人的。除丹尼索瓦3的基因組外，研究人員還從另外7個(gè)個(gè)體零碎牙齒、腳趾骨化石中，獲得了核DNA和線粒體DNA片段。而這些化石都來自丹尼索瓦洞穴。

研究人員還在現(xiàn)在的巴布亞人和漢族人等體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了一些丹尼索瓦人的DNA，這些DNA是從過去的雜交繁衍中獲得的。

丹尼索瓦洞穴的挖掘工作一直在持續(xù)，俄羅斯科學(xué)院（RAS）考古學(xué)家Maxim Kozlikin在丹尼索瓦洞穴20萬年前的沉積層發(fā)現(xiàn)了一顆男性臼齒。RAS團(tuán)隊(duì)將其送往馬克斯-普朗克研究所。在那里，進(jìn)化遺傳學(xué)家提取了足夠的DNA，使基因組測序覆蓋度達(dá)24倍，發(fā)現(xiàn)其不屬于已測序的基因組。于是Peyrégne和同事在計(jì)算生物學(xué)家Janet Kelso的實(shí)驗(yàn)室，將新的DNA序列與尼安德特人、其他丹尼索瓦人和現(xiàn)代人的DNA序列進(jìn)行比較。

根據(jù)Peyrégne和同事的分析，這名丹尼索瓦男性——丹尼索瓦25來自一個(gè)與丹尼索瓦3不同的早期丹尼索瓦人群體。他還從一個(gè)古老的、此前未知的尼安德特人群體中繼承了5%的基因組，表明丹尼索瓦25所在群體被后來的群體取代。數(shù)據(jù)還表明，丹尼索瓦25的祖先曾多次與尼安德特人交配繁衍。

從中國發(fā)現(xiàn)的一塊下頜骨化石表明，丹尼索瓦人臼齒比尼安德特人更大，下面部很結(jié)實(shí)。但由于化石稀少，沒有人知道丹尼索瓦人到底長什么樣。

Peyrégne介紹，根據(jù)大約12萬年前的化石，丹尼索瓦人在洞穴中顯然被尼安德特人取代了一段時(shí)間。到大約6萬年前，丹尼索瓦人搬了回來。因此這兩個(gè)群體甚至可能在洞穴里見過面。一名5萬年前女性骨骼化石的DNA顯示，她的母親是尼安德特人，而父親是丹尼索瓦族人。DNA和化石證據(jù)都表明后來現(xiàn)代人類占領(lǐng)了這個(gè)洞穴，丹尼索瓦人和尼安德特人消失了。Peyrégne說，該地區(qū)是各種人交匯的“十字路口”。